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國內在9月下旬起，正式讓12歲至17歲青少年接種輝瑞/BNT新冠肺炎（或稱COVID-19、武漢肺炎）疫苗第1劑。但有研究指出，青少年打BNT疫苗可能出現罕見心肌炎副作用，目前英國、香港皆已決定先讓青少年打1劑BNT疫苗即可。因此中央流行疫情指揮中心宣布暫緩12歲至17歲施打第2劑BNT疫苗，並決定再觀察2週，收集更多資料、檢視國內現有心肌炎病例後，再決定是否開放施打第2劑。但近日傳出基隆市暖暖高中已先為校內約400多名學生接種第2劑BNT疫苗。對此指揮中心指揮官陳時中表示，校方未依地方衛生局規定就提前開打，還是要把負責的態度拿出來。

對於暖暖高中偷跑為學生接種第2劑BNT疫苗一事，基隆市衛生局回應，指揮中心10月中決定，12歲至17歲接種第2劑BNT疫苗的間隔時間，從4週延長到10週，隨即通知各校和醫療院所延後施打BNT疫苗第2劑，但僅暖暖高中仍按原訂時程間隔4週就施打疫苗。基市衛生局亦表示相關資訊已回報中央流行疫情指揮中心，目前監測學生健康至今，尚無通報不良反應。

暖暖高中則表示，9月24日學生開打第1劑BNT疫苗時，合約診所的醫師表示兩劑BNT疫苗之間要間隔4週，當時就預計要在10月29日開打第2劑，學校也有向衛生所遞交施打名冊，直至10月29日展開接種作業時，都未被通知施打政策有變。

對於相關爭議，指揮中心指揮官陳時中今（12）日在疫情記者會中表示，指揮中心對於青少年接種BNT疫苗第2劑議題，都是「宣布開打才能開打」，縱使從研究數據看來接種第2劑不會有傷害，但校方沒依地方衛生局的規定就提前開打，還是要把負責的態度拿出來。



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